前言
脂质是一类自然界存在的疏水或****、难溶于水而易溶于非极性溶剂的有机物小分子,存在于大多数生物体系中。脂质是细胞膜的骨架物质和第二能量来源,还参与细胞的许多重要功能,人类许多重大疾病都与脂质代谢紊乱有关,如糖尿病、肥胖病、癌症、阿兹海默症、以及一些传染病等,
作为代谢组学的重要分支之一,脂质组学(Lipidomics)的研究对象是生物体的所有脂质分子,并以此为依据推测其它与脂质作用的生物分子的变化,进而揭示脂质在各种生命活动中的重要作用机制。脂质组学是总体研究和这些疾病有关的脂质化合物,找到昭示这些疾病的生物标记物。
2005年国际上把组织、细胞中的脂质分子分为8大类(J Lipid Res 2009,50(Supp);9-14),有明确结构的脂质化合物已经有38000个(BMC Bioinformatics 2014, 15(Suppl 7):S9),这8类脂质分子见表1。
表 1 8大类脂质分子
类别
| 缩写
| 数据库中的结构数量
|
脂肪酰类(Fatty acyls)
| FA
| 2678
|
甘油脂类(glycerolipids )
| GL
| 3009
|
甘油磷酸脂类(glycerophospholipids)
| GP
| 1970
|
鞘脂类(sphingolipids )
| SP
| 620
|
固醇脂类(sterol lipids )
| ST
| 1744
|
异戊烯醇脂类(prenol lipids ()
| PR
| 610
|
糖脂类(saccharolipids )
| SL
| 11
|
多聚乙烯类(polyketides )
| PK
| 132
|
在过去,由于技术限制人们难以分析数量巨大的脂质分析,因为多种脂质代谢产物的物理性质需要大批纯化系统、分离的复杂技术操作。2003年韩贤林等继基因组学、蛋白质组学等之后提出脂质组学(lipidomics)(Han X et a1.J Lipid Res,2003,44:1071),脂质组学的发展推动了新分析平台的研发,特别是在质谱法领域,该方法已使这些操作合理化,并且已允许更多的脂质分子得到非常详细的分析。
脂质存在于细胞、细胞器和细胞外的体液如血浆、胆汁、乳、肠液、尿液中。若要研究某一特定部位的脂质,首先要将这部分组织或细胞分离出来。由于脂质不溶于水,通常采用有机溶剂进行萃取。传统的萃取剂是**仿、甲醇和水的混合液。所需的样品在这种混合液中提取所有脂质,向提取液中加入过量的水使之分成2个相,上面是甲醇和水,下面是**仿。脂质就留在**仿相,蒸发浓缩后,使之干燥就得到所需的脂质。这种脂质提取方法,能够提出组织样品中的总脂。这种方法降低了脂质的损失率,操作简便,而且提取效果较好。对于只检测总脂中的部分脂质,固相萃取(SPE)是一种较好的方法,利用固体吸附剂将液体样品中的目标化合物吸附,与样品的基体和干扰物分离,然后再用洗脱液洗脱或加热解吸附,达到分离和富集目标化合物的目的。固相萃取技术设备要求低,操作简单,能快速分离组分复杂及含量低的样品。当然由于化学分析样品前处理技术的发展,有许多其他可用的样品前处理方法。
总体上对脂质组学的研究Chin Chye Teo等归纳为如下的工作流程,第一步就是对样品的处理。
1、脂质组学研究的工作流程
根据Chin Chye Teo的综述报告(Chin Chye Teo et al,TrAC,2015,65:1-18),脂质组学研究的工作流程如下表1.
表1 脂质组学研究的工作流程
从患者得到脂质组学研究的样品
|
液体
| 固体
|
体液,泪水,血清,血浆,尿液
(低温保存样品)
| 细胞,组织,器官
|
对上述样品进行萃取方法
|
对极性化合物,单独的有机化合物进行:
液-液萃取,固相萃取
| 对能源性物质进行:加压液相萃取,微波辅助萃取,超声辅助萃取
|
萃取得到的脂质化合物
|
使用色谱方法分离:气相色谱,液相色谱,电泳
| 不使用色谱方法分离:直接进样,成像
|
上述分离或未分离样品进行质谱分析
|
质谱分析的接口
| 质量分析器
|
电子轰击电离(EI),电喷雾电离(ESI),化学电离(CI),大气压(APCI)化学与电离,基质辅助激光解析电离(MALDI)
| 四级杆飞行时间质谱(qTOF),三重四级杆质谱( qqq),轨道阱质谱(Orbitrap)
|
质谱原始数据语预处理
(利用商品或自制软件)
|
分类和脂质鉴定(使用各种资源如LIPID maps,Lipid Bank,Lipid Blast)
|
判定在疾病中的机制/在疾病演化中的作用
|
为进一步诊断找出生物标记物(预防),提供药物治疗的指导
|
2、脂质组学的样品制备
本文只讲脂质组学的样品制备,Chin Chye Teo等总结了近年在脂质组学研究中使用的样品处理方法,见表2.
表2 脂质组学研究中的样品处理方法比较(Chin Chye Teo et al,TrAC,2015,65:1-18)
萃取方法
| 临床样品类型
(生物液体或固体)
| 优点
| 缺点
| 原文文献编号
|
单一有机溶剂萃取(SOSE)
| 血清(生物液体)
皮肤(固体)
| 容易完成
萃取时间短
成本低
低温适于热敏感化合物
无需外部能量
| 使用有毒有机溶剂
分析时难以摆脱使用有机溶剂
| 1.2
3
|
液-液萃取(LLE)
| 眼泪(生物液体)
血清(生物液体)
血浆(生物液体)
尿液(生物液体)
滑液(生物液体)
动脉粥样硬化血小板(生物液体)
皮肤(固体)
组织(固体)
| 易于建立的方法
容易完成
设备便宜
萃取时间短
使用廉价溶剂(如甲醇,水)
低温适于热敏感化合物
无需外部能量
萃取时间短
| 使用大量有毒有机溶剂
常使用超过一种类型的溶剂
需要排除溶剂以免影响分析
| 2
4,9-13
5,14-22
8,23
7
24
25-27
28,29
|
固相萃取(SPE)
| 血清(生物液体)
血清(生物液体)
血浆(生物液体)
眼(固体)
皮肤(固体)
| 容易完成
清除干扰基体
EPE的选择
低温适于热敏感化合物
萃取时间短
| SPE萃取小柱比较贵
需要洗掉有机溶剂以免影响分析
使用有毒有机溶剂
分析时难以摆脱使用有机溶剂
| 1,12
2
30
26
3,27
|
固相微萃取(SPME)
| 肺(固体)
头发(固体)
| 容易完成
可与GC和GC xGC 联用
对挥发性化合物可以进行顶空气相色谱
有毒溶剂消耗量少
低温适于热敏感化合物
无需外部能量
萃取时间短
| 萃取头比较贵
需要洗掉有机溶剂以免影响分析
分析时难以摆脱使用有机溶剂
| 31
32
|
超临界流体萃取(SFE)
| 血浆(生物液体)
| 容易完成
萃取时间短
对非极性化合物萃取效率高
CO2可循环使用
温度压力可控
可加改性剂提高萃取液极性和效率
| 要精心操作
设备昂贵
| 33
|
微波辅助萃取(MAE)
| 血浆(生物液体)
皮肤(固体)
| 容易完成
萃取时间短
萃取效率高
萃取溶剂消耗量少
温度压力可控
| 需要冷却防止溶剂逃逸
购买设备费用高
| 34
35
|
超声辅助萃取(UAE)
| 血(生物液体)
| 容易完成
萃取时间短
萃取溶剂消耗量少
温度压力可控
| 听力会受损
要使用有毒有机溶剂
会吸入有害溶剂
需要外部能源
购买设备费用高
提高温度会使化合物降解
| 36,37
|
3、脂质组学的溶剂萃取
液-液萃取是脂质组学研究中使用最为普遍的方法,这一方法是使用两种互不混溶的有机溶剂——使用最多的是**仿、甲醇和水——为了对关键脂质类得到最大的萃取效率,从磷脂类和糖脂类到脂肪酸,三酰基甘油类(TAGs)、二酰基甘油类(DAGs)。最初使用的是Folch 脂质萃取法(**仿/甲醇/水为 8:4:3 v/v/v),之后有Bligh 和 Dyer脂质萃取法(**仿/甲醇/水为 1:2:0.8 v/v/v)。
(1)Folch 脂质萃取法(Folch et al., J Biol Chem 1957, 226: 497)
把样品组织用2:1**仿/甲醇均一化,最后的溶剂体积是组织的20倍(20mL 溶剂里有1g样品),分散均匀后于室温下把混合物在轨道振荡器上震动15-20min。均匀混合物经漏斗中折叠滤纸过滤,或进行离心处理,回收液相。
液相溶剂用0.2体积的水(20 mL液相使用4 mL水),最好使用0.9%的NaCl溶液洗涤,涡旋几秒后在低速离心机(2000 rpm)上离心混合物,用虹吸方法弃去上层液相,用以分析神经节糖苷或小分子有机极性化合物,如需要(需移去标记分子),用1:1甲醇/水洗涤交界处的有机相两次,无需混合全部制备物。
经离心分离后虹吸掉上面的液相,下面含有脂质的**仿在旋转蒸发器中真空蒸发,或用氮气吹拂到2-3 mL体积。
(2)Bligh 和 Dyer脂质萃取法(Can J Biochem Physiol 37:911-917)
a. 每1 mL 样品加入3.75mL 1:2(v/v) CHCl3:CH3OH 很好涡旋,如果要进行GC 分析,溶剂中要含有内标(如0.5μg谷甾醇)
b. 然后加入1.5mL CHCl3很好涡旋
c. 最后加入1.25mL蒸馏水很好涡旋
d. 在1000rpm离心机中室温下离心5min,得到一个两相分离(上层为水相,下层为有机相)的液体
好看更多>> 文章来源:https://www.instrument.com.cn/news/20150519/160962.shtml